หลังการจำหน่ายเพียงไม่กี่ชั่วโมงสำนักแกะเจ้าดัง iFixit ได้ชำแหละ iPhone 6s และ iPhone 6s Plus พบความเปลี่ยนแปลงหลักๆ ดังนี้ ซีพียู Apple A9 APL0898 และรวม M9 ไว้ในชิป แรม LPDDR4 2GB ชิปควบคุม 3D Touch Apple 343S00014 และ Taptic Engine ชิป LTE Qualcomm MDM9635M ใช้อลูมิเนียมซีรีส์ 7000 (iPhone 6 และ 6 Plus ใช้ซีรีส์ 6063) และกระจกแบบ Ion-X iFixit ให้คะแนนความง่ายในการซ่อมสำหรับ iPhone 6s และ iPhone 6s Plus ที่ 7 เต็ม 10 คะแนน เท่ากันกับ iPhone 6 และ iPhone 6 Plus เมื่อปีที่แล้ว ที่มา – iFixit 1, 2 iPhone 6s, Apple, Hardware, iFixit,