การใช้คอนเทนเนอร์มาช่วยแยกระบบออกเป็นส่วนๆ อาจจะช่วยเพิ่มความปลอดภัยให้กับระบบโดยรวมได้ในบางกรณี แต่ปัญหาการที่นักพัฒนาไม่อัพเกรดซอฟต์แวร์ในคอนเทนเนอร์เป็นปัญหาเรื้อรัง และสร้างช่องโหว่ให้กับระบบ ล่าสุดบริการเก็บอิมเมจ Quay.io ของ CoreOS ตรวจสอบพบว่าอิมเมจที่เก็บไว้ยังมีช่องโหว่ Heartbleed ถึง 80% ทาง CoreOS จึงเปิดซอร์ส Clair เครื่องมือเตือนให้นักพัฒนารู้ว่าควรอัพเดตซอฟต์แวร์ได้หรือยัง Clair รองรับ Debian, Ubuntu, และ CentOS และใช้ตัวจัดการแพ็กเกจพื้นฐานของระบบ (dpkg, yum) และในอนาคตจะรองรับระบบจัดการ package เพิ่มเติม ที่มา - CoreOS CoreOS, Security